深圳市南山区人民医院消化科是南山区卫生系统的重点专科。消化科拥有一批专业基础扎实，临床经验丰富的高素质业务骨干。对消化系统各种疾病的诊治具有较高水平。消化科各种医疗设备齐全、先进，包括电子胃镜，电子结肠镜，电子十二指肠镜，经鼻超细电子内镜，胶囊内镜，NBI放大及染色内镜，小肠镜等。门诊是我科的窗口，每年接诊病人超过43000人次。每天有3位高级职称专科医师出诊，以尽可能满足病人的就诊需要。门诊除诊治消化系各种疾病外，口臭、慢性便秘及各种慢性脂肪性肝病诊治亦是我科特色。科内开放床位30张。年收治病人约1150人次。收治病种涵盖了消化系统常见病、多发病及疑难杂症。治疗的病种包括：（1）胃食管反流病/反流性食管炎；（2）胃十二指肠疾病（贲门失弛缓症、糜烂性胃炎、消化性溃疡并出血、消化道肿瘤）；（3）急、慢性胆囊炎；（4）肝脏疾病（各种原因引起的肝硬化所致的并发症、肝脏血管瘤及原发性肝癌介入治疗、酒精性与非酒精性脂肪肝/脂肪性肝炎药物及仪器治疗术、肝脓肿/巨大肝囊肿B超引导下穿刺抽脓（囊液）术等；（5）肠结核和结核性腹膜炎；（6）炎症性肠病（溃疡性结肠炎、克罗恩病）；（7）上消化道及大肠息肉的内镜下治疗；（8）各种原因引起的上、下消化道出血的诊治，包括小肠出血的DSA下血管造影/栓塞治疗术等；（9）功能性胃肠病（功能性消化不良、肠易激综合征）；（10）急慢性胰腺炎；（11）慢性便秘等。专科实验室可开展（1）14尿素-呼气试验（14C-UBT）诊断幽门螺杆菌，血清幽门螺杆菌毒力菌株抗体检测，对存在消化性溃疡、慢性胃炎伴糜烂或伴胃粘膜萎缩、不典型增生、肠上皮化生；胃MALT淋巴瘤、早期胃癌术后、有胃癌家族史及需长期口服解热镇痛类药物者，对于诊断有无胃幽门螺杆菌感染及治疗是否彻底、有无复发具有重要价值。（2）口臭吹气试验。
诊疗腹痛，腹胀，胃痛，胃胀，胃肠出血，肠梗阻，胃肠肿瘤，各种疝气
胃胀、胃痛、消化不良、胃食管反流病、食管炎、食管癌、胃炎、胃溃疡、胃癌、胃出血、胃石症、胃息肉、幽门螺杆菌感染、急慢性腹泻、便秘、肠梗阻、消化不良、肠出血、肠结核、结肠息肉、呕吐、呃逆、腹胀、腹痛、腹泻、厌食、消瘦、营养不良等，需要进行胃镜、结肠镜、十二指肠镜、超声内镜检查诊断治疗者等。
对普通外科（胃肠出血，消化道出血、胃肠穿孔、甲乳等）常见疾病有较丰富的临床经验；对腹腔镜治疗在胃肠外科应用有较深认识。
消化系疾病及肝胆疾病疑难重症的诊断治疗，尤其在溃疡病、小肠出血、胰腺炎、各种肝脏疾病如肝炎、肝硬化、脂肪肝等疾病的诊治和研究方面有着丰富的经验。